多年来，我国国家各级领导非常关心农业信息化问题，然而，在人增、地减、水成的情况下，要继续发挥农业对国民经济的支撑作用，难度越来越大，农业仍然是国民经济中最薄弱的环节，因此，实现现代化智慧农业是一项长期而艰巨的系统工程，信息化智慧农业是其中不可或缺的环。总体而言，我国农业生产呈现着强地域性、组织分散性、时空多变性和信息封闭的特征。正是由于我国南北气候差异、东西地形各异，以及东中西不同地区的经济发展水平也不一致，因此，在不同的地区形成了不同的作物生产带，在不同作物生产带收获的农产品，除了供本地消费外，更多的会在全国甚至全球范围内流通。随着人们对健康和绿色食品关注度的提高，如何保障绿色和安全的生产、加工和运输，如何实现高效率和可持续的农业发展，都需要智慧农业信息化技术的支撑，这其中面临着众多的困难。
第一，智慧农业信息化面临的问题是农业基础设施薄弱，农民稳定增收依然困难，农村社会事业发展依然滞后，城乡经济社会发展失衡、差距继续拉大等基本状况。由于我国人均占有农业资源的水平低，人均耕地不到0.1公顷，仅为世界平均水平的1/3; 人均草地0.3公顷，不到世界的1/2;人均林地0.1公顷，为世界的1/8，农业资源承载的压力很大。此外，随着城市化进程的加快，更多的农村劳动力正在逐步转移，从事农业生产的人员数量逐年降低。综合来看，由于我国农业劳动生产率低、资源稀缺，综合利用率低且存在资源逆向流动，近10年来，我国粮食生产成本以平均每年10%的速度递增，小麦、大米、玉米、大豆、高梁、大麦等价格已均高于国际市场价格。更严重的是，农业生产条件和基础设施薄弱，信息化推广缺乏硬件基础，现代化程度弱，抗御自然灾害的能力低，每年受灾面积为1500~ 3000万公顷，进一步导致了农业丰产增收的难度加大。
第二，农业基层从业人员科技素质以及科技生产手段仍然较为落后。据农业部统计，在我国4.9亿农村劳动力中，高中以上文化程度的仅占13%，接受过系统农业职业技术教育的不足5%。农业信息员队伍数量不足、素质不高、利用不够，信息资源开发程度低，服务形式单一、手段落后。农业的物质技术装备程度低，多数地区停留在手工劳动阶段。农村教育落后，文盲半文盲还在不断增加，科技人员不足且在不断流失，科技手段落后，科学技术在农业增长中的贡献仅为30%左右，远低于发达国家60% 80%的水平。信息化智慧农业最终要靠有文化、懂技术、会经营的新型农民，才能更好地接受信息化带来的信息，并将这些高新技术运用到生产实践中去。相对偏低的农民素质带来了农业信息化软件功能的不完善，必然是发展智慧农业信息化的瓶颈。
第三，农业科技研发能力和推广力度与国外相比还有所欠缺。目前国家重视智慧农业信息化的发展，但是对智慧农业信息化研发能力和推广力度不足。中国农科院的专家测算，对农业科技每1元钱的投入，回报是9.59元。当前，加快完善基层农业技术研发和推广体系十分关键。要不断增加现代农业科研专项，支持重大农业科技项目，加强国家基地、区域性农业科研中心建设。继续增加农业科技成果转化和推广投入，建立乡村级农民技术员队伍，树立科技示范农户，组织培训农民，引导农业科技新成果进村入户。高度重视土地、水及环境等方面先进适用技术的推广应用，走高产、优质、高效和可持续的智慧农业发展道路。
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